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208 个结果
  • 简介:【背景】齿裂大戟原产于北美,是近年来入侵我国的一种检疫性杂草。目前,该杂草已在我国的华北、华东和西南建立种群,并呈扩散蔓延趋势。由于该入侵植物具有极强的繁殖能力,一旦大面积扩散势必造成极大损失,急需通过风险评估明确其未来的扩散趋势,进而制定早期预警措施。【方法】使用MAXNET模型,运用齿裂大戟在原产地和中国的已知分布数据及筛选后的环境变量,结合地理信息系统(Geographicinformationsystem,GIS)及其生活史特征和环境适应特性,直观和定量地预测了该原产北美的植物在中国的适生范围,并采用受试者工作曲线(Receiveroperatorcharacteristiccurve,ROC)分析方法对模型预测结果进行了检验。【结果】齿裂大戟在我国有较为广阔的潜在分布区,其中高风险区主要集中在地处33°~40°N,109°~119°E的北京、天津、河北南部、河南北部、山东中北部、山西南部和陕西西安等地。【结论与意义】结合齿裂大戟在我国的分布现状和传入扩散特性,划定了其在我国潜在的高风险区域,为制定预防和控制入侵植物进一步传入和扩散的早期预警和监测措施提供科学依据。

  • 标签: 齿裂大戟 最大熵模型 入侵植物 生态位 潜在分布区预测
  • 简介:【背景】白花鬼针草为农区恶性杂草,原产于美洲,现已广泛分布于世界热带及亚热带地区,但其在全球和中国的适生区域及适生等级还不明确.【方法】利用MaxEnt生态位模型对白花鬼针草在全球以及中国的潜在适生区进行预测.【结果】白花鬼针草在全球的分布更多受到温度因素的影响.白花鬼针草的适生区主要集中在北半球和南半球15°-30°之间的热带和亚热带地区.其中,北美南部、南美中南部、非洲南部、东南亚北部以及大洋洲中南部沿海地区为白花鬼针草中、高度适生区.白花鬼针草在中国的适生区主要位于广东、广西、海南、云南、福建、台湾.到2070年,白花鬼针草在全球的适生区面积与当前相似,但在中国的适生区有所增大.【结论】白花鬼针草在我国有进一步扩张的风险.

  • 标签: MAXENT 白花鬼针草 潜在分布区 预测
  • 简介:[目的]建立禽流感H5N1病毒感染恒河猴的动物模型,探讨禽流感在哺乳类动物的发病机制。[方法]通过“环甲膜穿刺术”经气管注射鸡胚培养的禽流感H5N1病毒(AF148678;ACGoose/Guangdong/11961H5N1)感染恒河猴,观察恒河猴染毒后出现的临床体征,用显微计数法检测外周血白细胞的动态变化,用ELISA检测禽流感病毒特异性抗体变化规律,用流式细胞仪检测外周血T淋巴细胞及其亚群的动态变化。在染毒后第1天、第3天、第10天和第14天分别剖杀染毒组恒河猴1只,HE染色观察主要组织器官的病理变化,用病毒分离、免疫组化和RT-PCR三种方法分析禽流感病毒侵袭机体的特点。[结果]临床症状和体征:急性起病,表现为发热,呼吸困难,精神状态下降,活动度明显减少,食欲下降,咳嗽,紫绀等,肺部听诊双肺可闻及干、湿音。1、病理特点:以肺部损伤为主,伴多器官病变。肺部的病变主要表现为弥漫性肺泡损伤,先后经历渗出期、增生期和纤维化期;在肝脏、肾脏和中枢神经系统中也观察到变性、坏死等病理变化。2、病毒侵袭机体的特点:病毒只在呼吸系统中复制,不在呼吸道以外的组织器官中复制;肺内支气管上皮细胞、肺泡上皮细胞和肺巨噬细胞是...

  • 标签: H5N1禽流感病毒 恒河猴 非人灵长类动物模型 病理变化 免疫组织化学 病毒分离
  • 简介:TheNetAcetmethodhasbeendevelopedtomakepredictionsofN-terminalacetylationsites,butmoreinformationofthedatasetcouldbeutilizedtoimprovetheperformanceofthemodel.Byemployinganewwaytoextractpatternsfromsequencesandusingasamplebalancingmechanism,weobtainedacorrelationcoefficientof0.85,andasensitivityof93%onanindependentmammaliandataset.Awebserverutilizingthismethodhasbeenconstructedandisavailableathttp://166.111.24.5/acetylation.html.

  • 标签: N-端 乙酰化作用 支持向量分析 蛋白质 变异 预测方法
  • 简介:流行性感冒A病毒(H1N1)2009,一个新猪起源流行性感冒A病毒,世界范围地被散布了并且引起了大公共害怕。高产量的transcriptomics和proteomics方法现在正在被使用识别H1N1和H1N1主人相互作用。这篇文章在H1N1诊断,处理,和H1N1病毒主人相互作用考察最近的transcriptomics和proteomics研究,到为进一步理解感染机制并且控制H1N1传播提供一些帮助。

  • 标签: 蛋白质组学 基因表达谱 A型流感病毒 转录组学 相互作用 控制传输
  • 简介:TheCoronaviridaefamilyischaracterizedbyanucleocapsidthatiscomposedofthegenomeRNAmoleculeincombinationwiththenucleoprotein(Nprotein)withinavirion.ThemoststrikingphysiochemicalfeatureoftheNproteinofSARS-CoVisthatitisatypicalbasicproteinwithahighpredictedpIandhighhydrophilicity,whichisconsistentwithitsfunctionofbindingtotheribophosphatebackboneoftheRNAmolecule.ThepredictedhighextentofphosphorylationoftheNproteinonmultiplecandidatephosphorylationsitesdemonstratesthatitwouldberelatedtoimportantfunctions,suchasRNA-bindingandlocalizationtothenucleolusofhostcells.SubsequentstudyshowsthatthereisanSR-richregionintheNproteinandthisregionmightbeinvolvedintheprotein-proteininteraction.TheabundantantigenicsitespredictedintheNprotein,aswellasexperimentalevidencewithsynthesizedpolypeptides,indicatethattheNproteinisoneofthemajorantigensoftheSARS-CoV.Comparedwithotherviralstructuralproteins,thelowvariationrateoftheNproteinwithregardstoitssizesuggestsitsimportancetothesurvivalofthevirus.

  • 标签: SARS 冠状病毒 N蛋白 结构分析 抗原性
  • 简介:流行性感冒的所有已知的子类型A病毒在野水鸟被维持,这些病毒的自然水库。流行性感冒A病毒被孤立从许多有改变病态和死亡率的动物种类。更重要地,流行性感冒A病毒与潜在地致命的结果在人引起呼吸疾病。在人的本地或全球的爆发被过量住院和死亡典型地描绘。在1997,H5N1子类型的高度病原的鸟的流行性感冒病毒在传给人的香港出现了,导致由鸟的流行性感冒病毒感染的人的死亡的首先记录的盒子。在越南,印度尼西亚,和泰国在家禽在2003年7月开始的新爆发,和高度病原的鸟的H5N1流行性感冒病毒后来在整个亚洲并且进欧洲和非洲传播了。这些病毒继续与高死亡率感染人并且引起隐约可见的世界范围的担心流行。而且,H5N1病毒爆发在整个亚洲在家禽工业上有破坏效果。因为H5N1病毒爆发看起来从南部的中国发源,我们这里在中国检验H5N1流行性感冒病毒,与他们的生物性质上的一个重音。

  • 标签: 甲型流感病毒 H5N1型 生物学特性 高致病性禽流感 H5N1禽流感病毒 H5N1亚型
  • 简介:Thesurfaceglycoproteinhemagglutinin(HA)helpstheinfluenzaAvirustoevadethehostimmunesystembyantigenicvariationandisamajordrivingforceforviralevolution.Inthisstudy,theselectionpressureonHAofH5N1influenzaAviruswasanalyzedusingbioinformaticsalgorithms.Mostoftheidentifiedpositiveselection(PS)siteswerefoundtobewithinoradjacenttoepitopesites.SomeoftheidentifiedPSsitesareconsistentwithpreviousexperimentalstudies,providingfurthersupporttothebiologicalsignificanceofourfindings.ThehighestfrequencyofPSsiteswasobservedinrecentstrainsisolatedduring2005–2007.PhylogeneticanalysiswasalsoconductedonHAsequencesfromvarioushosts.Viraldriftisalmostsimilarinbothavianandhumanspecieswithaprogressivetrendovertheyears.OurstudyreportsnewmutationsinfunctionalregionsofHAthatmightprovidemarkersforvaccinedesignorcanbeusedtopredictisolatesofpandemicpotential.

  • 标签: H5N1病毒 选择压力 血凝素 演变 系统发育分析 流感病毒
  • 简介:早在70年代,Anfinsen就提出蛋白质分子的一级序列决定其空间结构的论断,这一论断得到多次实验证实并被人们广泛接受,成为蛋白质结构预测的理论基础。由于蛋白质分子的结晶非常困难,因此蛋白质三维结构预测成为目前了解蛋白质结构信息的重要手段,这一研究领域也成为蛋白质工程研究的一个非常活跃的方向。

  • 标签: 同源模建 蛋白质空间结构 蛋白质分子 蛋白质结构预测 目标蛋白 序列相似性
  • 简介:预言潜水艇的能力从它的顺序的蛋白质的细胞的本地化是很重要的,它关于蛋白质的功能提供信息。我们在场一个计算工具,PredSL,它利用神经网络,Markov链,隐藏的Markov建模的侧面,和得分为潜水艇的预言的矩阵在从N终端氨基酸顺序的真核细胞的房间的蛋白质的细胞的本地化。它试图分类蛋白质进五个组:叶绿体,thylakoid,线粒体,能分泌的小径,和“其它”。当在一个五倍的交叉验证过程测试了时,PredSL分别地为植物和非植物数据集表明86.7%和87.1%全面精确性。与TargetP,迄今为止是最广泛地使用的方法,和LumenP相比,PredSL的结果在大多数情况中是可比较的。当在Saccharomycescerevisiae染色体的试验性地验证的蛋白质上测试了时,PredSL可比较地表现如果比为一样的任务的任何可得到的算法不好。而且,PredSL是为这些的预言有能力的唯一的方法代替作为通过URL:http://bioinformatics.biol.uoa.gr/PredSL/的独立应用可得到的细胞的本地化。

  • 标签: 基因序列 蛋白质 亚细胞 缩氨酸
  • 简介:目的为建立溶血性贫血(HA)和再生障碍性贫血(AA)两种贫血动物模型.研究HA和AA的发病机理。方法50只杂种健康家兔随机分为两组,25只皮下注射盐酸苯肼制备溶血性贫血(HA)模型;另25只行^60Coγ-射线亚致死量全身照射后输注同种异体胸腙淋巴细胞诱发AA型。结果HA组成功率100%,死亡率56%(14/25只);AA组成功率为92%(23,25只)。结论两种模型的发生时间较稳定,实验重复性好,结果可靠,这为HA和AA发病机理的探讨丑实验性研究莫定了基础。

  • 标签: HA AA 溶血性贫血 发病机理 成功率 全身照射
  • 简介:前列腺癌鼠模型是研究前列腺癌的重要工具,目前常见以下4类:自发和诱发鼠模型,异种移植鼠模型,转基因鼠模型和基因敲除鼠模型。简要综述了前列腺癌鼠模型的研究进展。

  • 标签: 前列腺癌 鼠模型 异种移植 基因敲除
  • 简介:银屑病是一种长期困扰人类的疾病,具有病程长、易复发、难治愈的特点,其病因及发病机制至今尚未完全清楚。银屑病动物模型的建立对揭示该病遗传背景、发病机制及开发新药等都有极大的促进作用。因此,国内外学者在该领域进行了大量的研究。本文就银屑病动物模型的研究状况作一综述。

  • 标签: 银屑病 动物模型
  • 简介:目的建立急性痛风性关节炎(acutegoutyarthritis,AGA)大鼠模型并观察其维持时间。方法采用25mg/mL尿酸钠(monosodiumurate,MSU)晶体混悬液踝关节腔注射复制大鼠AGA模型,多个时间点动态观察8d,以大鼠受试踝关节局部皮温、肿胀度、步态、关节液炎性细胞及其滑膜组织病理形态学改变等指标判断是否成模及其维持时间。结果造模后3h,生理盐水组和模型组均可见踝关节肿胀,皮温升高,步态异常,关节液炎性细胞数增多,滑膜组织增生、毛细血管充血、滑膜细胞排列紊乱等炎症表现,两组以上指标与空白组比较差异均有显著性(P〈0.01);造模后4h,生理盐水组以上炎症表现明显减轻,较3h时差异有显著性(P〈0.01),而模型组较3h时加重(P〈0.01),并且与生理盐水组比较差异有显著性(P〈0.01);造模后24h,生理盐水组各项指标恢复正常,而模型组炎症继续加重;造模后48~72h,模型组肿胀、皮温、步态异常等局部炎症达到高峰;造模后96~168h,模型组踝关节局部炎症逐渐减轻,但各项指标与空白组比较差异仍有显著性(P〈0.01);造模后192h,模型组肿胀、皮温、步态异常等外在炎症表现恢复正常,而炎性细胞数及滑膜病理变化与空白组比较差异仍均有显著性(P〈0.01)。结论采用MSU晶体混悬液踝关节腔注射可在造模后4h成功制备并鉴定出AGA大鼠模型,且至少能维持到造模后168h。

  • 标签: 急性痛风性关节炎 大鼠模型 尿酸钠 维持时间
  • 简介:SARS-CoV感染动物模型的建立可加深对SARS病原学的了解和发病机制的研究,加速实验室诊断技术的建立、抗病毒药物的筛选和疫苗的开发,同时也有助于给该病一个更精确的定义。可以说SARS动物模型的建立,不但是SARS研究的瓶颈问题,其应用更是贯穿SARS研究的整个过程。到目前为止,已经报道有4种非人灵长类动物(恒河猴、食蟹猴、绒猴、非洲绿猴)和6种啮齿类动物(大鼠、小鼠、豚鼠、田鼠、仓鼠、转基因鼠),以及雪貂、家猫等可以作为SARS动物模型用于实验研究,并已经开始利用动物模型进行疫苗和药物的安全性和有效性评价。本文就已报道的各类SARS动物模型进行综述,并根据动物模型和SARS患者的比对,提出动物模型建立的技术要点。

  • 标签: 严重急性呼吸综合征 动物模型 病理 冠状病毒
  • 简介:目的构建一个简单、经济的新的甲真菌病体外模型.方法制备猪甲板,在其腹侧面中央黏贴一个“O”型圈,将受试菌液加入“O”型圈内,将甲板放置培养皿中培养,用大体观察及组织病理的方法动态观察不同真菌侵袭甲板的情况.结果用猪甲板制备甲真菌病体外模型,通过该模型观察了红色毛癣菌、须癣毛癣菌以及白念珠菌穿透甲板的能力.通过组织病理学方法观察到了真菌动态穿透甲板的过程.结论该模型适用于评估真菌对甲板的致病作用.

  • 标签: 甲真菌病 体外模型 皮肤癣菌 白念珠菌
  • 简介:结核分枝杆菌是引起人结核病的主要病原,全世界约有1/3人口感染结核分枝杆菌。尽管该病原可感染并引起许多动物疾病,但人类是其中心宿主。为研究结核分枝杆菌的致病机理及宿主对本病原的保护性和免疫病理学反应,选择合适的动物模型非常必要。本文阐述了结核病研究中常用的实验模型及各种模型的优缺点。实验模型的合理应用将促进我们对结核病的认识,从中获取的资料将有助于我们发现更好的预防和治疗方案。

  • 标签: 结核分枝杆菌 动物模型 组织培养模型