简介：高通量测序技术的飞速发展让生物信息领域迎来了大数据时代。新技术在提供海量生物遗传信息的同时,也给分析这些数据带来了新的挑战。DNA序列比对是信息分析流程中的关键步骤,为后续的变异检测提供序列比对信息。2015"深圳杯"数学建模夏令营B题以DNA序列比对为研究课题,希望参赛学生给出序列快速比对的最佳方案。本文简要点评了各参赛队伍的解答情况,然后介绍了现有DNA序列比对软件中用到的算法和数据结构。

简介：应用模糊分类的思想，利用多元统计方法完成对DNA序列的分类界定。

简介：序列比对是将蛋白质中的基因或氨基酸进行对齐的动作,目的是要找出两序列的相似程度,而多重序列比对则是同时比对多个DNA或蛋白质序列,找出此序列群组中最佳的比对结果.本研究结合遗传算法及模拟退火算法,先利用遗传算法优化种群的概念,随着世代演进逐渐产生近似最佳解,再利用模拟退火算法进行小区块内的比对修正.实验结果显示,利用遗传算法与模拟退火算法的结合,使得遗传算法在跳脱局部最佳解的时候能有更大空间移动,而且也让模拟退火算法能有效解决经由遗传算法初步比对之后所产生的不良区域.两种算法结合的序列比对结果比任何单一算法的结果好,因此可以提升整体比对效果,将来能够为生物学家在判断未知序列功能时提供适当的帮助.

简介：据中国农科院最新消息,该院蔬菜花卉研究所蔬菜功能基因组学创新团队与国内外同行合作,发现了一个大片段DNA序列拷贝数变化可以决定黄瓜的性别。相关成果发表于最新一期国际著名学术期刊《植物细胞》。团队首席、中国农科院蔬菜花卉所研究员、深圳农业基因组所副所长黄三文介绍,大片段DNA序列的结构变异（StructuralVariation,简称SV）包括插入/缺失、拷贝数变化和倒位等多种类型,可引起许多人类疾病（如自闭症和精神分裂症）的发生;

简介：本文提出DNA序列相似度指标,建立DNA序列比对算法。首先,将水生生物DNA样本序列与现有的基因库中的DNA序列逐项比对;其次,在满足特定阈值条件下,确认样本序列的分类。利用Java编程语言来实现算法,通过MonteCarlo模拟和实际应用,验证算法的有效性。理论结果表明：在满足特定阈值条件下,通过计算DNA序列相似度,能够确定数据库中与未知DNA样本序列最相似的序列,判断样本序列的分类。模拟实验、对比研究和应用结果表明：相似度指标算法在有效判别DNA序列的分类,提高DNA序列匹配成功率,降低程序复杂度等方面具有优良特征。

简介：阿根廷科学家近日成功将该国国歌旋律以人工基因编码形式植入某种细菌染色体中。这一方法不仅可以用来存储音乐旋律，还可能发展为一种拥有巨大应用潜力的信息存储方式。

简介：目的获得东方田鼠的特异DNA序列.方法Aβ基因使用PCR,基因克隆,斑点杂交,DNA序列分析,生物信息学技术.结果根据小鼠MHCⅡ外显子2及其两侧序列,合成引物并扩增东方田鼠基因组DNA,将PCR产物回收、测序后,分别设计内引物扩增东方田鼠基因组DNA,其中一对引物可得到特异性扩增带,将得到的DNA片段插入PGEM-Teasy载体,进行序列分析.用这对引物扩增人、昆明小鼠、BALB/c小鼠及C57BL/6J小鼠基因组DNA,均无扩增产物.以东方田鼠特异性扩增产物为探针进行斑点杂交,除东方田鼠基因组DNA外,其他几种动物基因组DNA均为阴性结果.进一步对该DNA片段进行了BLAST同源性搜索和外显子预测,在Genbank中没有发现高度同源序列,并且找到一个可能的外显子,该外显子由69个氨基酸组成.结论获得的DNA片段为东方田鼠的特异片段,这将为从分子水平深入研究东方田鼠的遗传背景、生物进化规律以及东方田鼠抗日本血吸虫的机理奠定基础.

简介：摘要目的本研究以目前国际病毒分类委员会（ICTV）所接受的肠道病毒分界标准为基础，通过客观地比较全基因组/多聚蛋白两两相似值，试图寻找一种简单可靠的方法来对新的肠道病毒进行的分类。方法分析960株肠道病毒在全基因组水平上的两两比对相似值（pairwise identity scores，PIS）的频率分布图，观察在不同肠道病毒型别、不同种及不同属之间是否存在明显的分类界限，结合病毒聚类和系统发育树的结果寻找能够区分肠道病毒不同种/属的标准。结果肠道病毒不同种间及与相近病毒属之间在全基因水平上存在比较好的PIS分类界限。多聚蛋白核苷酸PIS为0.657和0.536时可对肠道病毒进行可靠、稳定的种和属的分类。结论肠道病毒多聚蛋白核苷酸序列间PIS在种和属水平上具备明显的遗传边界，并能够简单、可靠地用于肠道病毒监测实验室新种属的初步鉴定。

简介：十二音体系的建立,对传统的旋律组织法作了彻底的变革,在音乐中奠定了序列主义的基础。但作曲家们并没有满足于“音高”的序列化,为了创造全新的音乐语言,他们的下一个目标是彻底改革传统的“节奏”组织法。

简介：指纹远程比对系统是根据基层指纹信息比对需求设计开发．包括指纹数据录入、上报、查询、下载、管理及多库并发查询等内容．涉及中心系统并行处理．远程站指纹图象高倍压缩、解压、保真，远程特征自动编辑、下发等多项计算机指纹信息的前沿技术研究。该系统硬件基本配置十分简单．仅需一台普通微机和一台扫描仪．即可以实现在异地直接输入指纹．通过公安专网直接查询中心库或异地库的指纹数据．具有输入、处理、传送、认定、管理等各种功能，可以进行正查、倒查、串查、查重等四种远程比对．

简介：对数的大小比较是高中数学的一个难点.主要方法有图象法、比商比差法、放缩法、利用换底公式法等.在这里引入一种新的方法——我称之为同底法.例1比较对数log25和log311的大小.分析可以看出,log25和log311都介于2,3之

简介：目的研究改进现有指纹自动识别系统的比对速度。方法将大量的比对数据提前加载到内存中,结合多线程并行计算,达到一次加载多次使用的目的。结果多组测试数据证明内存比对方式可以有效减少访存时间,提高了整体比对速度。结论指纹系统的内存比对方式是快速可行的比对方法。

简介：无论是高贵优雅的气质淑女，还是青春逼人的靓丽少女，皮草衣都能轻松满足你的需求，打造属于你的个人风格。皮草衣奢华、高贵的属性，致使根根皮草就像分子般进行着扩散运动，时时飘散出独特出众的女性魅力。

简介：<正>陈老师是女老师,有点胖,戴副眼镜,唐山人。初二时,新开历史课,她教我们历史。中国历史开课不久,讲到类人猿,给我印象最深。不是我尤其喜欢类人猿,而是因为陈老师的口音。

简介：AventadorLP700-4还是延续了Lamborghini的一贯设计风格，显得粗犷而霸气，浑身充满了如蛮牛般的力量。而从整体感觉上，我们也能从其身上看到Murcielago、Renventon以及SestoElementoConcept的影子。

简介：真的假不了,假的真不了,真真假假错不了。几次DNA测试,不但测出了骨肉亲情,也测出了人心善恶。

简介：乔皮奇体质不好,老是感冒发烧。“太影响学习了,”乔皮奇生自己的气,“如果我能不生病就好了!”

简介：<正>2006年NBA选秀大会已经尘埃落定一个多月了,然而还是有一些东西值得我们津津乐道地去分析一番,这其中当然免不了大家关注的外籍军团。自从2002年以来,5年里NBA诞生了姚明、博古特、巴格纳尼三位外籍状元,毫无疑问,NBA选秀的国际化已经成为不可阻挡的历史洪流。而有些可惜的是,我们在第二轮仍然无法看到中国球员唐正东的名字。尽管大唐本人一直为他的NBA之梦而不懈地努力,然而残酷的竞争却让我们不得不去尊重这一个事实。或许在明年或者后年的选秀会上,中国球员会有更多的表演空间,因为届时我们将会看到易建联、孙悦这样的身影。

简介：根据mtDNAD-loop基因对钦州茅尾海尖鳍鲤群体（n=34）的遗传多样性进行了研究.通过PCR技术进行了mtDNAD-loop基因扩增,检测到变异位点共计18个,占全部的1.97%.其中：3个是颠换位点,14个是转换位点（C-T,A-G）,1个转换位点与颠换位点同时存在.34尾个体分属14种单倍型.尖鳍鲤线粒体DNA（mtDNA）核苷酸多样性（π）为0.00301,平均核苷酸差异数（K）为2.747.单倍型多样度（H）为0.911,单倍型间平均遗传距离（P）为0.004.用单倍型间遗传距离构建的NJ系统树由4个支系组成.尖鳍鲤茅尾海种群线粒体（mtDNA）D-loop基因多态性较低,表明该种群遗传多样性相对较低,因此,保护尖鳍鲤种质资源刻不容缓.

简介：序列连通性具有许多相似于连通的性质.本文讨论了拓扑空间的序列连通性,并给出了序列连通空间的刻画及其性质.