简介：为了利用关联分析发掘与重要农艺性状相关的数量性状基因位点，本研究采用全基因组扫描的方法，利用分布在基因组上的60对SSR引物，对140份东北三省水稻种质资源进行群体结构和连锁不平衡分析。结果表明：本研究中东北粳稻可分为2个类群，线性和非线性组合中，都有一定的连锁不平衡存在。群体中，19．2％的标记位点可以观察到显著的LD（P〈0．05），其中第一类群和第二类群基于D’统计概率（P〈0．05）支持的LD成对位点比例分别为2．1％和16．6％。第2类群连锁不平衡衰减（D’〈0．5）所延伸的遗传距离变幅为0．32—120．4cM，回归方程为：y=-0．0276ln（x）＋0．3994。

简介：FLOWERINGLOCUSD（FLD）是植物自主开花途径花发育基因，在植物营养生长向生殖生长转变的过程中起重要的调控作用。本研究利用同源基因克隆法结合RACE技术克隆了蜻蜒凤梨似echme口触ciat曲花发育基因FLD的类似基因AfFLD。序列分析比对表明，AfFLD所推测的氨基酸序列包含有LSDl-LIKE亚家族两个高度保守的结构域：SWIRM结构域和胺氧化酶结构域，该蛋白与玉米、拟南芥的FLD蛋白的同源性分别为72％3N73％。利用实时荧光定量PCR（qRT-PCR）技术分析了乙烯处理不同时间FLD基因的表达模式，结果表明乙烯处理不同时间的各组中，处理后1d时FLD的表达量达到最高值，其中表达量最高为0h的2．5倍。本结果为开花自主途径中相关基因对乙烯处理后的响应机理的研究提供理论基础。

简介：根据黄瓜基因组数据库中CsaO20719基因编码区全序列设计引物，通过RT—PCR扩增的方法从黄瓜品种津研四号的叶片中克隆得到寡肽转运蛋白基因（oligopeptidetransportergene，OPT）。基因编码区全长为2013bp。该基因编码的蛋白由20种氨基酸组成，含有670个氨基酸残基，分子量和理论等电点分别为73kD和8．65。预测由该基因转录的寡肽转运蛋白为疏水蛋白，有14个连续的疏水片断。预测该蛋白不存在信号肽，为非分泌蛋白，存在OPT家族保守结构域，亚细胞定位在细胞膜上，主要功能为参与转运和底物结合。同源性和进化树的预测分析显示，OPT蛋白与毛果杨和蓖麻寡肽转运蛋白同源性分别达到了81％和79％，所转运的底物除有寡肽外，还包含有金属离子-烟草胺的螯合物等。qRT—PCR分析同一氮浓度处理OPT基因在不同部位表达结果显示，在无氮及低氮条件下，OPT基因在茎中表达量最高，其次为叶和茎尖。在高氮条件下，OPT主要在茎尖和叶中表达量较高，其次为茎，说明OPT基因在氮胁迫下存在于植物各个部位，并主要集中在生长旺盛的部位，为黄瓜的生长提供所需的能量。不同氮浓度下OPT在茎中表达分析结果显示，OPT基因在无氮及低氮下表达量增加，明显高于正常水平，并且随着氮浓度的降低，OPT的表达量增加，说明黄瓜OPT基因参与低氮胁迫应答反应，增强黄瓜耐低氮能力。

简介：为探究大豆应答非致病菌（Bipolarismaydis）胁迫的分子机制，将玉米小斑病菌接种于3周龄的大豆苗。取48hpi的大豆叶片以TCA／丙酮法提取蛋白质，利用蛋白质双向电泳技术分离蛋白，串联质谱（MS＋MS／MS）鉴定蛋白质再结合生物信息学技术进行蛋白质功能分析。结果显示：分离到大豆苗期叶片总蛋白点1300＋15个，其中，差异表达（2倍以上，P值〈0．05）的蛋白质点18个，除2个蛋白点未成功测序，其余16个差异蛋白点经GO分析可知，差异表达的蛋白质功能主要涉及光合作用、胁迫应激和非寄主抗性响应，如核酮糖1，5-二磷酸羧化酶、病程相关蛋白PR-10和细胞骨架结构相关蛋白profilin-2。同时，由测序结果推测：在非致病菌（玉米小斑病菌）的胁迫下，大豆通过降低光合作用相关蛋白和能量代谢相关蛋白的表达，来增强防御相关蛋白和非寄主抗性相关蛋白的表达。

简介：研究甘蓝型油菜种质的遗传多样性，以提高甘蓝型油菜种质的利用效率。本研究从140对甘蓝型油菜SSR引物中，筛选出40对多态性好的SSR标记，并结合植株田间农艺性状特征鉴定，对63份来自四川的甘蓝型油菜种质资源进行遗传多样性、群体结构和性状关联分析。研究结果表明：40对多态性好的引物共检测到152个等位变异，引物平均多态性位点3．8，平均多态信息量（PIC）0．8497；在带型分析基础上，根据相似系数将参试材料聚为5大类群，多数参试材料属于第2、3大类群；在SSR多态信息基础上，对参试材料进行群体结构分析，将参试材料分为4个群体，86％的参试材料Q值大于0．70。对40个SSR位点与8个主要农艺性状用TASSEL软件的GLM（generallinearmodel）模型进行关联分析，共检测到15个位点与农艺性状显著相关，其中6个位点极显著相关。这6个SSR位点分别为：yw222和ywy05标记与全株角果数极显著相关，yw140和yw134标记与主序角果数极显著相关，ywy19和yw138标记与一次分支数极显著相关；其中ywy19同时与每角粒数、主序角果数、主序有效长显著相关。研究结果表明，本研究参试材料具有较好的代表性，遗传多样性较丰富；研究分析所得与农艺性状极显著关联的SSR标记位点在提高甘蓝型油菜种质的利用效率方面具有重要的实践意义。

简介：本研究以云南小油菜为材料，克隆出乙酰辅酶A羧化酶的BCCP亚基基因，并对克隆基因进行生物信息学分析，结果表明云南小油菜BCCP基因含有6个外显子，编码258个氨基酸，有四个功能保守区，第四功能保守区是生物素化功能域，并且RT—PCR结果表明该基因是表达、有功能的。云南小油菜BCCP亚基与甘蓝型油菜Bp4的氨基酸序列相比较，有30个氨基酸发生变化；云南小油菜BCCP基因的ORF与甘蓝型油菜Bp4mRNA的同源性高达96％。

简介：类黄酮（Flavonoids）是植物体内一类重要的次生代谢产物，它以结合态（黄酮苷）或自由态（黄酮苷元）形式存在于水果、蔬菜、豆类和茶叶等许多植物中，对植物的生长发育有着重要的调节作用。查尔酮合成酶（Chalconesynthase，CHS，EC2．3．1．74）是植物类黄酮合成途径的第一个关键酶，在调控类黄酮的生物合成以及类黄酮的成分起着决定作用。本研究基于番茄全基因组测序数据，利用生物信息学方法，鉴定了查尔酮合成酶基因家族成员，分析其内含子一外显子的结构特征、系统发育关系，序列结构的保守性以及染色体上的分布。研究表明：查尔酮合成酶（S1CHS）是含有8个成员的多家族基因，蛋白质序列编码位于160（S1CHS05）～438（S1CHS08）个氨基酸之间；相似性在33．7％（S1CHS02和S1CHS06）～92．0％（S1CHS04和S1CHS07）之间，表明这些序列之间具有较高的遗传多样性；此外，结构分析发现这些基因均含有较少的内含子（0～2个）；序列比对表明这些基因具有较高的保守性；它们不均匀分布在番茄的1、5、6、9和12号染色体上。该研究不仅有助于未来了解该基因家族的进化起源提供参考，而且可为我们进一步分析该基因家族成员的功能奠定基础。

简介：霜霉菌是一种在十字花科作物中寄主范围很广的专性寄生菌。本研究综合运用病菌形态学观察、病菌致病性测试和rDNA-ITS序列分析三种方法对北京地区的大白菜和甘蓝寄生霜霉菌进行比较，以期发现二者的进化关系。结果显示：两种病原菌在形态学上没有明显区别；但是对大白菜的致病力具有显著差异：大白菜霜霉菌对大多数参试的大白菜材料具有致病性，而甘蓝霜霉菌只是诱导大多数大白菜材料产生过敏反应，对个别易感大白菜材料具有较弱致病力；将rDNA—ITS序列提交至NCBI，大白菜和甘蓝霜霉菌的rDNA—ITS序列登录号分别为JF975613和JF975614，序列比对发现二者的序列一致性高达99．59％；利用19个十字花科霜霉病菌的ITS序列构建系统进化树，结果表明二者与寄生在甘蓝和甘蓝型油菜上的霜霉菌以100％的支持率聚在同一分支。

简介：以阿蒂擎天凤梨乙烯处理和不处理的植株为材料建立的抑制性差减杂交文库中，筛选到的一个被乙烯诱导并与已知植物谷胱甘肽-S-转移酶（GST）同源的cDNA片段，通过RACE技术得到该基因的全长eDNA序列。序列分析表明，该基因可能属于thioredoxin-1ikesuperfamily和GSTC_familysuperfamily两个超家族中的成员。利用半定量RT—PCR检测该基因的表达量在乙烯处理后先会在1h显著升高，然后随时间逐步降低，说明乙烯作为一种逆境胁迫相关激素，可在短时间内诱导凤梨中GST的表达。推测其在受到外源乙烯信号诱导后，一方面可能参与了植物体内的解毒作用，另一方面可能参与了花青素的合成调控和运输。本实验中的GST作为观赏凤梨中一个新发现的GSTs家族成员，对于研究热带花卉中GSTs家族的特点和提高其抗逆性和品质具有重要的理论意义和实用价值。