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402 个结果
  • 简介:WedevelopedanRfunctionnamed'microarrayoutlierfilter'(MOF)toassistintheidentificationoffailedarrays.Insortingagroupofsimilararraysbythelike-lihoodoffailure,twostatisticalindiceswereemployed:thecorrelationcoefficientandthepercentageofoutlierspots.MOFcanbeusedtomonitorthequalityofmi-croarraydataforbothtroubleshooting,andtoeliminatebaddatasetsfromdown-streamanalysis.Thefunctionisfreelyavaliableathttp://www.wriwindber.org/applications/mof/.

  • 标签: 检测芯片 财政部 异常点 相关系数 统计指标 故障检修
  • 简介:MYB蛋白质在真核细胞的有机体起重要作用。在植物,R1R2R3类型MYB蛋白质在房间周期控制工作。然而,R2R3类型MYB蛋白质是否也涉及房间部门过程,仍然保持未知。这里,我们报导那R2R3类型抄写因素基因,AtMYB59,涉及房间周期前进根生长的规定。AtMYB59蛋白质在洋葱的原子核是局部性的表皮的房间并且transactivation活动。在酵母房间的AtMYB59的表示压制房间增长,transformants与更长的房间有更多的原子核更高的aneuploidDNA内容。在AtMYB59的保存领域的变化在酵母细胞生长上废除它的效果。在同步Arabidopsis房间暂停,AtMYB59基因明确地在房间周期前进期间在S阶段被表示。表示promoter-GUS分析表明AtMYB59基因富有地在根被表示。转基因的植物overexpressingAtMYB59更短的根与野类型的植物(Arabidopsis就职Col-0)相比,并且在在根尖端的有丝分裂的房间的一半附近在中期。相反地,空变异的myb59-1比关口在中期让更长的根更少有丝分裂的房间,建议那AtMYB59可以由扩大有丝分裂的房间的中期禁止根生长。AtMYB59调整许多下游的基因,包括CYCB1;1基因,可能通过到MYB应答的元素的绑定。这些结果在细胞周期规定植物根生长为AtMYB59支持一角色。

  • 标签: 转录因子基因 周期进程 根系生长 拟南芥 细胞
  • 简介:【背景】多样性比较是评价转基因作物对生物群落影响的标准参数之一。以往用于描述多样性的指数很多,但这些指数各有优缺点,生物学解释不全面。运用现代生物多样性表示方法,能够描述更复杂情况下的多样性关系。本文主要介绍了Rényi多样性指数曲线在生物安全研究中的应用。【方法】Rényi多样性指数曲线与以往常用的一维多样性指数不同,当其等级参数为某些特定值时代表了几个著名的多样性指数,该方法可较为确切地评价复杂的生物群落的多样性。本文在介绍其计算公式后,通过比较河北省2种转Bt基因棉田(孟山都33B中棉30,均未施农药)以及常规管理(施用农药)综合治理(IPM,施用农药释放赤眼蜂相结合)条件下非转基因棉田的蜘蛛群落,证明了该方法的适用性。【结果】Rényi多样性指数曲线分析表明了所有可能的互作类型:1明确的多样性排序以及2类棉田蜘蛛群落间不同的潜在关系。Rényi指数分析表明,在供试棉田中,中棉30棉田的蜘蛛多样性指数最高,其他3种棉田蜘蛛的多样性高低则难以一概而论。蜘蛛稀有种的多样性以孟山都33B棉田最高,IPM常规棉田次之;蜘蛛常见种的多样性以IPM棉田最高,常规棉田孟山都33B棉田次之。【结论与意义】Rényi多样性指数可用于生物群落多样性的综合评价,并可用于评价不同管理措施对生物多样性的影响。该方法弥补了仅用单一数量参数评价多样性的传统方法的缺陷,将不同参数整合成一具有内在关联的概念框架。

  • 标签: BT棉 可扩展多样性指数 农药效应 生物安全评价 生物多样性比较 Rényi多样性指数
  • 简介:从采自湖北四川省的土壤标本中分离到2中国新记录种——球孢黑孢霉(Nigrosporasphaerica)膨梗沃德霉(Wardomycesinflatus),并对二者进行了形态学描述绘图。研究菌株的干制培养物标本与活菌种均存放在山东农业大学植物病理学标本室(HSAUP)。

  • 标签: 球孢黑孢霉 膨梗沃德霉 土壤真菌 分类
  • 简介:5R618是高抗叶锈病小麦品系。为了确定该品系所携带的抗叶锈基因,以5R618与感病小麦品种郑州5389杂交获得F1,自交获得F2分离群体以及F2∶3家系,用叶锈菌生理小种THJP对亲本、F2分离群体以及F2∶3家系进行叶锈抗性鉴定,然后进行分子标记分析。结果显示,5R618对生理小种THJP的抗病性由1对显性基因控制,该基因暂命名为Lr5R。经过亲本抗感池间分子标记筛选以及F2∶3家系的标记检测,Lr5R定位于染色体3DL上,barc71STS24-16是Lr5R最近的2标记,遗传距离分别为0.9cM2.1cM。

  • 标签: 小麦抗叶锈病基因 遗传分析 分子标记
  • 简介:Amajorproblemwhichispoorlyunderstoodinthemanagementofbladdercancerislowsensitivitytochemotherapyandhighrecurrenceaftertransurethralresection.Insulin-likegrowthfactor1receptor(IGF-1R)signalingplaysaveryimportantroleinprogression,invasionandmetastasisofbladdercancercells.Inthisstudy,weinvestigatedwhetherIGF-1Rwasinvolvedinthegrowthstimulatingactivityanddrugresistanceofbladdercancercells.Theresultsshowed:ThemRNAsofIGF-1,IGF-2andIGF-1Rwerestronglyexpressedinserum-freeculturedT24cellline,whereasnormalurothelialcellsdidnotexpressthesefactors/receptorsoronlyintracelevels;T24cellrespondedfarbettertogrowthstimulationbyIGF-1thandidnormalurothelialcells;blockageofIGF1Rbyantisenseoligodeoxynucleotide(ODN)significantlyinhibitedthegrowthofT24cellandenhancedsensitivityandapoptosisofT24cellstomitomycin(MMC).TheseresultssuggestedthatblockageofIGF-IRsignalingmightpotentiallycontributetothetreatmentofbladdercancercellswhichareinsensitivetochemotherapy.

  • 标签: 胰岛素生长因子-1受体 信号系统 抗药性 细胞凋亡 膀胱癌
  • 简介:目的:通过检测藏獒黑素皮质激素受体1(MClR)基因的单链构象多态性(SSCP)在不同毛色群体中的分布,探讨MClR基因多态性与毛色表型的相关性。方法:采用DNA测序技术,选择不同毛色藏獒的DNA为样本,根据GenBank发布的荷斯坦牛MClR基因序列设计一对引物,采用PCR-SSCP技术分析MClR基因在藏獒中的SSCP。结果:MClR基因在藏獒中具有PCR-SSCP多态性,分别检测到3种基因型(AA、ABBB);对MClR基因多态性片段DNA克隆测序后发现,MClR基因在编码区第313位存在单碱基突变(G-,A),该突变导致第105位氨基酸发生由丙氨酸向苏氨酸的改变(T105A)。结论:肘CJR基因的多态性与毛色性状不存在显著的相关性。

  • 标签: 藏獒 毛色 黑素皮质激素受体1基因 多态性 PCR-SSCP
  • 简介:以采自浙江省丽水地区的7鹅膏菌属菌株作为研究材料,在基于形态特征进行初步鉴定的基础上,对7种鹅膏菌的rDNAITS区段进行克隆测序序列特征比较分析。进一步对ITS序列进行核酸序列数据库GenBank同源性检索比对,将从GenBank检索获得的9最相似物种的ITS序列连同7种鹅膏菌的ITS序列一起作系统发育分析。结果表明:基于ITS序列对f6、丹f493菌株的分子鉴定支持了基于形态特征的鉴定结果,对巧的分子鉴定不支持形态鉴定的结果.琚为鹅膏菌属内某种,f66为鹅膏菌属内某种,并与Amanitafulva,A,atrofusca,A.orientifulva3种鹅膏菌的亲缘关系较近,f7与另外6种鹅膏菌的亲缘关系相差甚远。研究结果提示基于分子水平上的ITS序列分析不能单方面作为大型真菌分类鉴定的可靠依据,可以作为基于传统形态学分类鉴定的辅助参考依据。

  • 标签: 鹅膏菌 rDNA 内转录间隔区(ITS) 序列分析 分类鉴定 大型真菌
  • 简介:突变体是基因功能研究品种改良的重要材料。本研究对一中品661EMS诱变的株型突变体(it1)进行了表型生理鉴定,旨在为该突变体的利用提供参考。结果表明:与野生型相比,突变体株型紧凑,节间缩短,叶片变小呈深绿色且皱缩;突变体高度降低为野生型的2/3,但节间数目与野生型无显著差别,说明it1株高降低是由每个节间长度缩短造成的,与节间数目无关;突变体的分枝数、荚数、粒数、叶柄长度及夹角、百粒重等产量性状均显著或极显著低于野生型。与野生型相比,突变体叶片叶绿素相对含量木质素的含量显著高于野生型。本研究结果为控制突变相关基因的定位、图位克隆功能分析以及育种利用提供了优良种质理论依据。

  • 标签: 大豆 EMS 株型 突变体
  • 简介:TheR(replicase)proteinistheuniquelydefinednon-structuralprotein(NSP)responsibleforRNAreplication,mutationrateorfidelity,regulationoftranscrip-tionincoronavirusesandmanyotherssRNAviruses.Basedonourcompletegenomesequencesoffourisolates(BJ01-BJ04)ofSARS-CoVfromBeijing,China,weanalyzedthestructureandpredictedfunctionsoftheRproteinincomparisonwith13otherisolatesofSARS-CoVand6othercoronaviruses.TheentireORF(open-readingframe)encodesfortwomajorenzymeactivities,RNA-dependentRNApolymerase(RdRp)andproteinaseactivities.TheRpolyproteinunder-goesacomplexproteolyticprocesstoproduce15function-relatedpeptides.Ahydrophobicdomain(HOD)andahydrophilicdomain(HID)arenewlyidentifiedwithinNSP1.ThesubstitutionrateoftheRproteinisclosetotheaverageoftheSARS-CoVgenome.ThefunctionaldomainsinallNSPsoftheRproteingivedifferentphylogeneticresultsthatsuggesttheirdifferentmutationrateunderselectivepressure.ElevenhighlyconservedregionsinRdRpandtwelvecleavagesitesby3CLP(chymotrypsin-likeprotein)havebeenidentifiedaspotentialdrugtargets.Findingssuggestthatitispossibletoobtaininformationaboutthephy-logenyofSARS-CoV,aswellaspotentialtoolsfordrugdesign,genotypinganddiagnosticsofSARS.

  • 标签: SARS 冠状病毒 R蛋白 结构 功能 基因序列
  • 简介:Fibrillin11(FBN11)是植物质体中FBN蛋白家族的重要成员之一,比其他成员多300~500氨基酸残基,说明其可能存在某些特异性结构功能。本研究在水稻幼苗中扩增获得到了一受非生物逆境胁迫诱导的OsFBN11基因的全长cDNA,该基因含有12内含子13外显子。其编码蛋白的分子量为72.36kD,pI值为9.26。生物信息学分析结果表明,该蛋白含有无规则卷曲、α螺旋β-折叠3种氨基酸二级结构,不含有跨膜结构域,蛋白亲水性强,PSORT软件预测该蛋白可能定位于叶绿体中。进一步对14种植物FBN11蛋白的同源性5物种该蛋白的保守结构域分析,发现该蛋白兼有典型的PAP-Fibrillin结构域蛋白激酶PKc结构域。水稻全生育期芯片分析显示该基因主要在愈伤组织、叶片根系中高水平表达。RT-PCR检测结果显示,该基因在水稻幼苗中受ABA、NaCl干旱胁迫处理上调表达。上述结果表明,OsFBN11可能在水稻质体发育抗非生物胁迫反应中发挥重要作用。

  • 标签: 水稻 Fibrillin基因家族 水稻FBN11基因 生物信息学分析 逆转录-聚合酶链式反应
  • 简介:为研究雄性不育相关基因TA1TA2在BNSYS小麦温敏雄性不育系732A花粉发育时期的表达特点,探讨这2育性相关基因与温敏雄性不育小麦育性转换的联系,本研究利用荧光实时定量PCR方法,在BNSYS型不育系732A花药发育四分体期、单核期、二核期三核期定量检测基因TA1TA2的mRNA表达水平。结果表明:(1)在732ABNS花粉发育四分体时期至二核期,基因TA1相对表达量上调,在三核期相对表达量下降;(2)基因TA2相对表达量在BNS花粉发育的四分体时期至二核期逐渐下降,三核期上升;在732A花粉发育4时期中的相对表达量变化刚好相反;(3)在BNS732A花粉发育二核期,基因TA1TA2均表现极值,推测二核期可能为BNSYS型小麦温敏雄性不育系花粉发育最敏感时期;(4)在不育系BNS732A花粉发育过程中,基因TA1的相对表达量变化幅度比TA2的高。推测TA1对不育系BNS732A花粉败育影响程度强于TA2;(5)基因TA1TA2相对表达量在BNS的花粉发育时期表达趋势相反,推测其对BNS花粉败育影响表现为拮抗作用,且2基因不连锁;在732A花粉发育时期表达趋势相同,推测其对不育系732A花粉败育影响表现为协同作用。

  • 标签: 小麦 TA1 TA2 BNS 732A 荧光实时定量PCR
  • 简介:报道了葡萄上两国内新记录真菌病害:由茶藤子小穴壳菌(Dothiorellaribis)引起的熟腐病败育假蜜环菌(Armillariellatabescens)引起的根腐病。病害附有症状病原菌的描述形态图。

  • 标签: 葡萄 熟腐病 蜜环菌根腐病 真菌性病害
  • 简介:报道了采自辽宁省浑河源自然保护区海棠山国家级自然保护区的8辽宁省新记录伞菌,分别是红鳞环柄菇(LepiotasquamulosaT.Bau&YuLi)、红鳞白环菇[Leucoagaricusrubrotinctus(Peck)Singer]、天鹅色环柄菇[Leucocoprinuscygneus(J.E.Lange)Bon]、银丝包脚菇[Volvariellabombycina(Schaeff.)Singer]、二孢蜡蘑[Laccar/atortilis(Bolton)Cooke]、黑毛桩菇[Tapinellaatrotomentosa(Batsch)Sut锄]、酒红褐鳞伞(Pholiotavinaceo—brurmeaA.H.Sm.&Hesler)、赭红方孢粉褶蕈[Entolomaquadraturm(Berk.&M.A.Curtis)E.Horak]。文中描述了这些种的宏观微观特征。

  • 标签: 伞菌 海棠山 浑河源 辽宁省 新记录种
  • 简介:报道了采自山东青岛的壳皮盘菌Pezizaostracoderma的2无性型,即腐生在辣椒种子上的广州堆孢珠头霉Oedocephalumglomerulosumvar.cantonense腐生在辣椒育苗钵基质(草炭及蛭石)上的黄色疣枝孢菌Chromelosporiumfulvum。前者为山东省新记录种,后者为中国大陆新记录种。

  • 标签: 壳皮盘菌 无性型 丛梗孢科 分类
  • 简介:Excel是常用的电子表格处理软件,笔者采用基于Excel的VBA编程方法,编写了“多项式的三角函数拟合单峰曲线”程序,经教学科研工作中使用,获得了理想的效果。文中发表了该程序的源代码及使用方法,供广大科教人员下载使用。

  • 标签: EXCEL VBA编程 多项式的三角函数 单峰曲线
  • 简介:采用SSR技术对黄淮麦区以1B/1R类品种为抗源育成的38小麦品种进行聚类分析。39SSR引物共扩增出186条谱带,其中143务为多态性条带,占76.9%。每个引物可扩增出1~9条多态性条带,平均3.7条。位点多态性信息含量PIC变幅为0.320-0.857,平均为0.634。聚类分析表明,在遗传距离GD值0.32水平上38小麦品种可聚成六大类。品种间遗传距离GD变幅为0.10769~0.48571。SSR标记揭示出这38具有黑麦血缘的小麦品种遗传变异较小,遗传基础比较狭窄。

  • 标签: 小麦 SSR 遗传多样性 聚类分析
  • 简介:美国国家癌症研究所(NCI)颁发980万美元给属于早期检测研究网络(EDRN)的17生物标记开发实验室,作为他们第一年的经费资助。新资助实验室的任务是发现与主要癌症相关的新生物标记,以及鉴定什么样的生物标记的制品能最好的检测癌症的存在或风险。EDRN的其他部门包括生物标记验证实验室、临床流行病学中心及数据管理综合中心。鉴于癌症是一种日益威胁人类生命安全健康的危险疾病,

  • 标签: 美国国家癌症研究所 生物标记开发实验室 经费 早期检测研究网络
  • 简介:目的探索小鼠基因组39微卫星的PCR条件,评价微卫星在小鼠遗传检测中的运用.方法采用梯度法探索39微卫星的PCR条件;选择本中心不同来源及引种时间的C57BL/6、BALB/c、DBA/2J、CBA/N、FVB/NJ、ICR共6品系(8组)小鼠,每组采用10只个体的鼠尾,提取DNA并混合成DNA池,用39微卫星扩增后电泳观察、比较种系纯度.结果小鼠微卫星的PCR条件差异较大,Mg2+浓度多数在1.5mmol/L左右,退火温度多数在59℃左右.在6品系小鼠的39微卫星位点中,C57BL/6、BALB/c、DBA/2J都是纯合的;其余品系有1~3杂合位点.BALB/c在D5Mitl68、D8Mit320、D13Mit262三位点,DBA/2J在D14Mit205位点与数据库记录有差异.结论本研究为小鼠39微卫星提供了候选的PCR条件,并对6品系小鼠的微卫星概貌及微卫星的运用价值进行了探讨.

  • 标签: 小鼠 微卫星 检测 PCR条件
  • 简介:选取19小麦叶锈菌生理小种对8小麦育种亲本进行成株期苗期抗叶锈病鉴定及基因推导,同时利用与24抗叶锈基因紧密连锁或共分离的31分子标记进行分子检测。推测出L83#-5与L83#-6含有Lr1,可能含有Lr2cLr42;L/PL2003-1含有Lr1,可能含有Lr2c、Lr28Lr42;贵农13号可能含有Lr28;92R137可能含有Lr2cLr28;L201含有Lr1,可能含有Lr2c、Lr16Lr28;TM可能含有Lr41其他抗叶锈基因。研究结果表明,测试的8小麦育种亲本中TM的抗叶锈性最好,具有很好的抗叶锈病应用潜力,可作为小麦抗叶锈病育种的重要抗源。

  • 标签: 小麦育种亲本 抗叶锈基因 基因推导 分子检测