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5 个结果
  • 简介:摘要目的对GI.1型札如病毒进行全基因组扩增测序尝试并开展初步分析。方法利用本研究设计的GI组札如病毒全基因组5’末端通用引物及杯状病毒3’末端引物,对本实验室保存的两株GI.1型札如病毒标本进行全基因组扩增,然后进行文库构建、上机测序及序列组装。通过BioEdit软件进行序列比对分析,采用MEGA 7.0软件构建进化树进行进化分析。结果两个标本测序质量优异,测序方法具有可行性;在全基因组(WGS)、NSP基因、VP1基因及VP2基因进化树中,均归类为GI.1型;位点变异分布于各个基因片段,但VP1基因的N端保守性较好,熵值较低;大部分基因的核苷酸突变尤其是NS3、NS5及VP1基因的核苷酸突变以同义突变为主,未形成相应氨基酸的突变。结论成功地开展了对GI.1型札如病毒全基因组扩增测序及相关进化分析,为札如病毒的检测提供了新的思路。

  • 标签: 札如病毒 全基因组 进化树 同义突变
  • 简介:摘要目的探究血清可溶性尿激酶型纤溶酶原激活物受体(soluble urokinase-type plasminogen activator receptor,suPAR)联合甲胎蛋白及终末期肝病模型(model for end-stage liver disease,MELD)评分对慢性乙型肝炎(chronic hepatitis B,CHB)相关慢加急性肝衰竭(acute-on-chronic liver failure,ACLF)患者近期预后的评估价值。方法纳入2018年1月至2020年5月于抚州市第一人民医院就诊的66例CHB相关ACLF患者,随访90 d后根据患者结局分为死亡组和存活组。采用简单随机抽样法抽取同期CHB患者30例。比较CHB相关ACLF患者和CHB患者血清suPAR,比较死亡组和存活组CHB相关ACLF患者血清suPAR、甲胎蛋白和MELD评分。采用受试者操作特征曲线下面积(area under the receiver operator characteristic curve,AUROC)分析suPAR、甲胎蛋白、MELD评分、蔡尔德-皮尤改良评分(Child-Turcotte Pugh score,CTP评分)与suPAR联合甲胎蛋白及MELD评分对CHB相关ACLF患者近期预后的评估价值。统计学分析采用两独立样本t检验、非参数检验。结果CHB相关ACLF患者血清suPAR水平为(9.6±0.8) ln ng/L,高于CHB患者的(8.0±0.3) ln ng/L,差异有统计学意义(t=14.533,P<0.01)。死亡组CHB相关ACLF患者的suPAR、MELD评分分别为(9.9±0.7) ln ng/L、29.6(7.1)分,分别高于存活组的(9.4±0.7) ln ng/L、21.0(5.0)分;死亡组甲胎蛋白为45.9(108.1) μg/L,低于存活组的209.3(187.1) μg/L。死亡组和存活组的suPAR(t=2.895,P=0.005)、MELD评分(Z=4.708,P<0.01)和甲胎蛋白(Z=3.051,P<0.01)差异均有统计学意义。suPAR(AUROC=0.741,P=0.001)、甲胎蛋白(AUROC=0.724,P=0.002)、MELD评分(AUROC=0.885,P<0.01)对CHB相关ACLF患者的死亡均有预测价值。suPAR、甲胎蛋白、MELD评分、CTP评分与suPAR联合甲胎蛋白及MELD评分的灵敏度分别为84.6%、73.1%、88.5%、96.2%、84.6%,特异度分别为75.0%、72.5%、70.0%、52.5%、92.5%。suPAR联合甲胎蛋白及MELD评分的AUROC为0.871(P<0.01),高于CTP评分的0.793(P<0.01)。结论CHB相关ACLF患者血清suPAR升高,suPAR联合甲胎蛋白及MELD评分可用于对CHB相关ACLF患者的预后评估。

  • 标签: 乙型肝炎,慢性 甲胎蛋白类 慢加急性肝功能衰竭 可溶性尿激酶型纤溶酶原激活物受体 终末期肝病模型评分
  • 简介:摘要目的了解苏州市5岁以下儿童A组轮状病毒(group A rotavirus,RVA)腹泻流行特征,为科学防控提供依据。方法采集2015—2019年在苏州某儿童医院住院的5岁以下腹泻患儿粪便标本1 634份,进行RVA/诺如病毒GІ/诺如病毒GΠ核酸三重实时荧光PCR检测,对RVA阳性标本进行札如病毒/腺病毒/星状病毒三重实时荧光PCR检测和G、P分型。同时收集患儿的人口学、临床症状和流行病学资料。结果检出RVA核酸阳性标本426份,检出率为26.01%,其中350份为单一RVA感染,混合感染76份,混合感染以RVA合并诺如病毒为主。RVA检出率高峰为每年11月至次年3月,检出率与气温成负相关。13~18月龄和19~24月龄组检出率较高,24月龄以下患儿占所有阳性患儿的85.55%(365/426)。RVA阳性组发生水样便和入院前呕吐的比例高于RVA阴性组,且呕吐次数更多。G9P[8]为优势基因型,感染不同基因型的患儿临床症状未见明显差异。结论RVA是苏州地区5岁以下儿童腹泻的重要病原体,需在冬春季加强2岁以下儿童轮状病毒腹泻的防控。

  • 标签: 轮状病毒 病毒性腹泻 儿童
  • 简介:摘要目的探讨肠道病毒71型(enterovirus A group 71 type, EV-A71)疫苗上市前重症手足口病(hand, foot and mouth disease, HFMD)中枢神经系统(central nervous system, CNS)并发症的类型、严重程度,为重症HFMD临床演变提供基础数据。方法采用描述性分析对2010—2016年南京市儿童医院、苏州大学附属儿童医院、无锡市人民医院、徐州市儿童医院报告的3 583例实验室确诊的重症HFMD的一般情况、临床表现、实验室指标进行统计,应用Logistic回归筛选增加HFMD严重程度的预警指标。结果重症HFMD病死率为8.09‰(29/3 583),入住儿科重症监护室(pediatric intensive care unit, PICU)率为11.75%(421/3 583),出院未愈的发生率为5.30‰(19/3 583),其中CNS并发症轻微组占39.02%(1 398/3 583),严重组占59.22%(2 122/3 583),危重组占1.76%(63/3 583)。危重组发病年龄在6~11月龄、不典型疹、呼吸系统症状/体征(气急、呼吸减慢、呼吸困难等)、神经系统症状/体征(手足抖动、抽搐、嗜睡、昏睡等)、循环系统症状/体征(心率加快、皮肤颜色异常、心律失常、四肢发凉等)、实验室检查(白细胞计数升高、淋巴细胞计数升高、血小板计数升高、C反应蛋白升高等)、临床辅助检查(脑电图、脑CT、胸片X线)等指标发生率在危重组高于其他2组,且有统计学差异(P<0.05)。Logistic回归模型显示:呼吸减慢、呕吐、脑膜刺激征等11个变量随着异常比例增大,CNS并发症严重程度升高(P<0.05)。结论易惊、呼吸减慢、呕吐、淋巴细胞升高、脑电图异常等指标对于重症HFMD患儿进展为不同严重程度的CNS并发症具有重要的临床意义。

  • 标签: 手足口病 重症病例 中枢神经系统 并发症 肠道病毒71型
  • 简介:摘要目的在同一个标本中检测出了两种组别的诺如病毒,对这两个诺如病毒的分子特征进行初步分析。方法利用普通RT-PCR对两个病毒的部分聚合酶区及衣壳蛋白区片段进行扩增和序列测定。通过BioEdit软件进行序列比对分析,采用MEGA软件及BEAST软件分别构建进化树进行进化分析,Simplot软件进行重组位点分析。结果序列进化分析显示标本中确实存在两种不同型别且不同组别的诺如病毒,分别为GI.6[P11]型与GII.13[P16]型;时间进化分析显示GI.P11位于2013—2018分支,GII.13位于GII.13[P16]的2013—2018分支,平均替换速率分别为1.6×10-3及1.9×10-3替换/位点/年;GII.13[P16]可能的重组位点在病毒的开放读码框架1上。结论本研究对少见的共感染的两种型别重组诺如病毒进行了初步分析,为同种型别的深入研究提供了基础参考数据。

  • 标签: 诺如病毒 重组 GI.6[P11] GII.13[P16]